University Côte d'azur
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ECUE SV : Structure et representation des molecules

ECUE's code : SPEV107

Belong to 2 UE
PORTAIL SCIENCES DE LA VIE
Chimie théorique, physique, analytique
Campus Valrose
Licence 1
Semestre impair
Français

PRESENTATION

Le corps humain est constitué d’environ 2,5.1027 atomes (2,5 milliards de milliards de milliards d’atomes)!!!  Une cellule, d’une taille de 20 à 100 mm, comporte encore 3.1014 atomes en moyenne! D’une façon plus générale, toute la matière qui nous entoure est formée de molécules, elles-mêmes composées d'atomes. La construction de ces molécules doit alors nécessairement suivre des règles précises et l’ensemble de leurs caractéristiques participera à donner à la matière chacune de ses propriétés.

L’objectif de ce cours est alors de donner les grandes règles de constructions des molécules, et plus particulièrement des biomolécules (enzymes, protéines, ADN, ARN...) afin d’en comprendre la structure tridimensionnelle et d’en aborder les fonctions.

Dans un premier temps, les constituants de la matière, que sont les atomes, seront redéfinis et l'évolution de leurs propriétés au sein du tableau périodique sera présentée (atomistique). Sur ces bases, les règles de contruction des liaisons seront abordées (Lewis, hybridation des orbitales atomiques) et leur influence sur les règles de construction leur strucutre tridimensionnelle sera présentée (méthode VSEPR). Les interactions intermoléculaires seront présentées (LiaisonH, VdW...) et permettront ne mieux comprendre l'organisation de la matière. Dans une dernière partie, les règles de nomenclature et de stéréochimie seront enseignées.

Course's manager(s)

Serge Antonczak , Mael Nicolas

In class

  • 14h of lectures
  • 16h of directed studies

PREREQUISITES

Before the start of the course, I must ...
  • maîtriser les cours suivants des années pré-bac (1ère et Terminale scientifiques) :
  • - Modèles ondulatoires et particulaires de la matière (1ère scientifique)
  • - Structure et propriétés des molécules et des ions (1ère scientifique)
  • - Structure des composés organiques (1ère scientifique)
  • - Représentation spatiale des molécules (Terminale Scientifique)
  • Tester mes connaissances en réalisant ce test de positionnement : https://lms.univ-cotedazur.fr/mod/quiz/view.php?id=30832

OBJECTIVES

By the end of this course, I should be able to...
  • - décrire la constitution d'un atome en précisant les particules le constituant et son organisation électronique
  • - caractériser toute liaison chimique en donnant son nom, son orientation, sa constitution...
  • - analyser la composition et la structure tridimensionnelle d'une molécule
  • - lister les possibles interactions intermoléculaires d'une molécule en se basant sur l'ensemble des atomes et sur l'enchaînement des liaisons
  • - nommer les molécules selon les règles en vigueur tenant compte de leurs propriétés stéréochimiques

CONTENT

  • Cet enseignement sera organisé autour des quatre chapitres suivants :

    1 - Constitution de la matière : présentation de la constitution d'un atome et construction de son cortège électronique, définition de ses propriétés en relation avec sa position dans le tableau périodique.

    2 - Lewis-VSEPR-Hybridation : description des différents types de liaison et de leurs propriétés, présentation des différentes méthodes/théories menant à une decription plus ou moins précise de leur constitution, limite des modèles.

    3 - Au delà de la liaison : participation de l'organisation électronique d'une liaison à l'organisation électronique d'une molécule (effets inductifs, mésomères...), définition des interactions intermoléculaires et de leur importance sur la structuration et la stabilité de la matière. Cas concrets impliquant des macromolécules biologiques.

    4 - Nomenclature et Stéréochimie : nommer les molécules selon les règles en vigueur tout en tenant compte de leur propriétés stéréochimiques.

    L'enseignement de chacune de ces parties de cours s'appuiera sur les activités suivantes :

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