University Côte d'azur

UED TIEX

ECUE's code : SMUSVPD

This course give 3.0 ECTS.
EUR LIFE
Neurosciences , Biologie cellulaire , Biologie des organismes , Physiologie
Campus Valrose
Master 1 , Master 2
Semestre pair
Français

PRESENTATION

Cette UE vise à faire découvrir des Technologies Innovantes en EXpérimentation (TIEX) sur des modèles biologiques utilisés dans les laboratoires de recherche de la région.


L'optogénétique, l'optopharmacologie, le Virus-Induced Gene Silencing et le Host-Induced Gene Silencing, le vidéophénotypage qui permettent l'exploration en biologie seront présentés et utilisés sur des systèmes modéles tels que la drosophile, le nématode, les plantes, le trichogramme.Ces systèmes biologiques présentent de nombreux avantages et permettent des découvertes fondamentales.

Des présentations théoriques accompagnées de manipulations ou démonstrations seront off ertes aux étudiants du master SV première et deuxième années.

Course's manager(s)

In class

  • 2h of cours magistral
  • 10h of travaux dirigés
  • 10h of travaux pratiques

PREREQUISITES

Before the start of the course, I must ...
  • Connaître les cours de licence SV, en particulier la neurobiologie et la physiologie animale et végétale.

OBJECTIVES

By the end of this course, I should be able to...
  • Découvrir des techniques d'exploration innovantes en biologie
  • Expérimenter des techniques d'exploration innovantes en biologie
  • Examiner/décrire les différents modèles biologiques autres que les mammifères

CONTENT

  • Amandine CHASSOT et GUILLAUME SANDOZ - IBV - Valrose


    Théorie (2h) : Présentation de différentes techniques de photopharmacologie : photoswitches synthétiques et rhodopsines virales et de leurs applications dans l’étude de la nociception et de la contraction musculaire dans différents modèles (nématodes, amphibiens, mammifères).

    Pratique (2h) : Télécommander la douleur avec une résolution spatiotemporelle : utilisation des outils développés dans notre laboratoire (Landra-Willm et al., 2023 Nature Communications ; Oliviera et al, en révision). 1ere partie : Manipulation par la lumière de l’activité neuronale associée à la douleur en électrophysiologie, 2e partie :   Manipulation réversible  par la lumière du comportement douloureux du ver C. Elegans.

  • Michael QUENTIN - INRAE - sophia AgroBiotech

    Théorie : Le Virus-Induced Gene Silencing et le Host-Induced Gene Silencing sont devenus des approches indispensables pour l'étude du dialogue moléculaire entres plantes et microorganismes phytopathogènes (Rössner et al., 2022, Annual Review of Plant Biology,

  • Caroline MEDIONI et Bruno HUDRY - IBV - Valrose

    Théorie : Présentation des atouts méthodologiques récents du modèle Drosophile en prenant exemple de la neuroscience. Les outils suivants seront présentés (permettant la caractérisation de circuits neuronaux contrôlant un comportement spécifique à toutes les échelles) : analyses clonales (Brainbow, Flybow, MARCM), connectome du cerveau entier avec une résolution au niveau synaptique, derniers outils de points en optogénétique permettant la manipulation de l’activité neuronale par la lumière. 

    Pratiques : Manipulation de l’activité de neurones moteurs spécifiques par la lumière grâce à des outils optogénétique pour induire des comportements, visualisation de circuits neuronaux (imagerie).

  • Eric Boncompagni et Olivier PIerre - INRAE - Sophia Agrobiotech

    Théorie : Modèles végétaux pour la compréhension de développement végétal et pour le processus de la symbiose fixatrice d’azote.

    Pratiques : Contraintes spécifiques de l’imagerie du tissu végétal (plateforme ISA-INRAE)

  • Vincent Calcagno, Géraldine Groussier, Elodie Vercken (ISA)

    Le trichogramme, et son utilisation comme espèce modèle en dynamique des populations (dynamique hôte-parasitoïde, lutte biologique, expansions spatiales) et écologie comportementale (optimal foraging, écologie du mouvement, personnalité).

    Pratiques : vidéophénotypage, vidéo-tracking, étude du comportement par analyse automatique de scènes vidéo.

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