Université Côte d'azur

UE39 Diagnostiquer le cancer: techniques et techno. cherch.

Code de l'ECUE : SMUSVI39

Ce cours donne droit à 6.0 ECTS.
EUR LIFE
Biochimie et biologie moléculaire , Biologie cellulaire , Biologie des organismes , Génie électrique, électronique, photonique et systèmes
Hors campus
Master 2
Semestre impair
Français

PRESENTATION

Diagnostiquer le cancer : Techniques et technologies au service du chercheur et du clinicien

Chaque type de cancer porte une signature cellulaire et moléculaire distincte. Grâce aux avancées technologiques, les médecins et les chercheurs ont aujourd’hui recours à différents types d’analyses cellulaires, moléculaires et d’imagerie pour détecter le cancer et identifier les différences entre les cellules cancéreuses et les cellules saines. Les enseignements ont pour objectif de présenter ces différentes technologies et leurs applications en clinique et en recherche.  

Les thématiques abordées seront les suivantes :

  • Biopsies liquides 
  • Biopsies solides
  • Cellules souches et OMIque 
  • Imagerie histologique et modèles animaux 
  • Canaux ioniques et imagerie médicale 

Les enseignements offrent, pour chaque thématique, une description des aspects fondamentaux puis leurs implications en recherche clinique et en thérapeutique. 

  • Equipe enseignante 

N. Arrighi (C3M), D. Ambrosetti (CHU), N. Amoretti (CHU), G. Baudin (CAL), F. Bost (C3M), F. Burel-Vandenbos (CHU), T. Cluzeau (CHU), L.Counillon (LP2M), B. Dadone-Montaudié (CHU), X. Descombes (INRIA), G. Cristofari (IRCAN), P. Colosetti (Lyon), J.M. Ferrero (CAL), M. Godinho-Ferreira (IRCAN), M. Ilié (CHU), M. Irondelle (C3M), S. Lassalle (CHU), T. Pourcher (CEA), E. Saada (CAL), T. Virolle (iBv), L. Yvan-Charvet (C3M), C. Zwarthoed (CAL).  

 

L'enseignement se fera sous forme de cours magistraux et de travaux dirigés. L’étudiant, au coeur de son propre processus d'apprentissage, sera amené à participer lors de ces enseignements, qui se veulent interactifs et constructifs.

 

Les cours auront lieu au Centre Antoine Lacassagne.

Responsable(s) du cours

, Lauris Gastaud , Marius Ilie , Thierry Virolle

Présentiel

  • 20h de cours magistral
  • 20h de travaux dirigés

PREREQUIS

Avant le début du cours, je dois ...
  • avoir validé le Master 1 scientifique, médecine, pharmacie, école vétérinaire ou écoles d'ingénieur.
  • avoir un niveau suffisant (B1) en Anglais (compréhension écrite, notamment pour la lecture d'articles scientifiques)
  • maîtriser les grandes fonctions physiologiques de la biologie cellulaire.

OBJECTIFS

A la fin de ce cours, je devrais être capable de...
  • connaitre les techniques et technologies utilisées en recherche fondamentale et appliquée
  • maitriser les modalités de diagnostic du cancer et les possibilités théranostiques
  • définir les outils de recherche adaptés pour un projet d’étude en oncologie

CONTENU

  • Matin 

    * Hématopoïèse normale et pathologique, cellules souches  

    * Cellules circulantes et ADNc  

     

    Après-midi  

    * Exosomes et autres nanovésicules 

    * Facteurs pronostiques biologiques, marqueurs tumoraux et suivi de maladie résiduelle 

  • Matin 

    * Prise en charge diagnostique, pronostique et théranostique des cancers 

    * La cytogénétique ; quand, comment ? 

     

    Après-midi  

    * Outils d’aide à l’analyse des biopsies, machine learning 

  • Matin 

    * Des cellules souches au cœur des tumeurs 

    * Les IPS véritable plateforme technologique en recherche médicale sur le cancer 

     

    Après midi 

    * Genomic OMICS : Innovations technologiques à l’échelle de la cellule unique pour disséquer les circuits moléculaires du cancer, du primaire aux métastases (NGS, RNA-seq, ATAQ-seq et CITE-seq)  

    * Proteomique, Metabolomique 

  • Matin 

    * H&E, immunohistochimie multiplex 

    * Techniques: Immunofluorescence, short term-culture, Patients derived xenograft, Imagerie intravitale 

     

    Après-midi  

    * La biopsie au laboratoire de recherche: pour quoi faire ? Modèles : ex-vivo, organoïdes 

    * Modèles GEM (ex. zebrafish)

  • Matin 

    * Evaluation en cancérologie (RECIST, RECISTm, PERCIST…) 

    * Les nouvelles techniques d’imagerie et Apports de l’IA en Imagerie Médicale 

     

    Après-midi  

    * Introduction générale aux canaux ioniques 

    * Canaux ioniques et transporteurs SIN 

    * Imagerie fonctionnelle et théranostique 

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