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ECUE SV : Mecanisme moleculaire en biologie

Code de l'ECUE : SPEV106

Ce cours est proposé dans 2 UE
PORTAIL SCIENCES DE LA VIE
Biochimie, biologie cellulaire et moléculaire, physiologie et nutrition
Campus Valrose
Licence 1
Semestre impair
Français

PRESENTATION

Dans ce cours, vous aborderez le monde du vivant à son niveau moléculaire. Vous utiliserez alors des notions de chimie (atomes, interactions et liaisons, énergie, équilibre, ionisation, pH, dissolution) que vous appliquerez aux systèmes et molécules biologiques en conditions physiologiques. Vous approdondirez le sujet avec trois grandes familles de biomolécules : les protéines, les glucides et les lipides. Vous analyserez leurs structures, apprendrez à prédire leurs propriétés physico-chimiques et biologiques puis découvrirez et appliquerez les méthodes d’études qui leur sont spécifiques et adaptées.

Responsable(s) du cours

, Sophie Raisin

Présentiel

  • 18h de cours magistral
  • 12h de travaux dirigés

PREREQUIS

Avant le début du cours, je dois ...
  • Connaître la valence des principaux atomes
  • Savoir écrire une équation bilan
  • Pouvoir résoudre une équation à deux inconnues
  • Connaitre les groupes caractéristiques de chaque famille chimique (ex: groupe hydroxyle pour la famille des alcools)
  • Connaitre la relation entre Log et puissance de 10
  • Réaliser le test d'auto-évaluation disponible à l’adresse suivante : https://lms.univ-cotedazur.fr/mod/hvp/view.php?id=268238

OBJECTIFS

A la fin de ce cours, je devrais être capable de...
  • Nommer et expliquer les lois et grands principes physico-chimiques qui s'appliquent et caractérisent le monde du vivant.
  • Nommer et dessiner précisément les molécules de base constituant les glucides, lipides et protéines. Expliquez leurs caractéristiques physico-chimiques et propriétés biologiques associées.
  • Résoudre des problèmes portant sur les quantités, les concentrations, les masses molaires, le pH, l'ionisation et la séparation des acides aminés.
  • Expliquer comment et dans quelles conditions les molécules de base s'associent pour former les macromolécules (protéines, lipides et glucides).
  • Décrire chimiquement, expliquer la structure, les propriétés physico-chimiques et en déduire la relation structure-fonction des macromolécules étudiées.
  • Distinguer les différentes méthodes d’analyse des macromolécules en fonction de leur objectif. En expliquer le principe et le fonctionnement. Résoudre des problèmes portant sur l'analyse ou la purification des macromolécules, prédire et expliquez les résultats expérimentaux.

CONTENU

  • Ce cours d'introduction a plusieurs objectifs.

    Le premier est de revenir avec vous sur la présentation du syllabus afin de répondre à un maximun de questions avant de commencer les enseignements.

    Le second est de définir, de situer le sujet de cette ECUE dans un contexte plus large, celui de la Biologie et d'en évaluer l'importance.

    1. Présentation du syllabus de l'ECUE (intervenantes, communication, fonctionnement, contenu, objectifs-compétences visées et évaluation)
    2. L'ECUE MMB dans le programme de 1ere année de SV
    3. les molécules, le niveau moléculaire, molécules dans un milieu aqueux, pH et tampons

  • Ce 2eme cours entre dans le vif du sujet. Ce sera aussi une séance de remobilisation de certaines notions acquises au lycée en chimie. Elle s'appuie donc sur un travail préalable de votre part, en partie accompagné par des ressources fournies. Certaines de ces notions seront revues et approfondies dans le cadre des UE ou ECUE de chimie en S1 et S2.

    Les notions qui seront abordées sont :

    • Niveau « molécule » : polarité, charges, encombrement stérique
    • Molécule dans son environnement : interactions (les forces qui s’exercent entre molécules) et réactions (les modifications de composition et de structure)
    • Les caractéristiques spécifiques des systèmes biologiques au regard des lois physico-chimiques

    Ce cours illustre le lien fort entre biologie et chimie au niveau moléculaire et atomique. Vous devrez entretenir ce lien en mettant en relation les notions et compétences acquises dans cette ECUE et dans celles de chimie.

  • Contenu:

    - les acides aminés

    - la liaison peptidique

  • Contenu:

    - les protéines

  • Contenu:

    - les méthodes d'étude des protéines

  • Ce cours magistral en deux parrties de 2h portera sur :

    Les oses

    1. Nomenclature 
    2. Carbone asymétrique et pouvoir rotatoire 
    3. Structure cyclique des oses et anomérie 
    4. Les oses modifiés 

    Les osides

    1. La liaison osidique 
    2. Les diholosides 
    3. Les polyholosides 
    4. Les hétérosides 
  • Aucune description

  • Ce cours magistral en deux parties de de 2h portera sur :

    Présentation générale des lipides

    1. Qu’est qu’un lipide 
    2. Structure générale 
    3. Importance dans les systèmes biologiques 

    Lipides vrais simples 

    1. Acides gras, briques élémentaires des lipides 
    2. Glycérolipides 
    3. Cérides 

    Lipides vrais complexes 

    1. Glycérophospholipides 
    2. Sphingolipides 

    Composés à caractère lipidique (lipoïdes) 

    1. Stéroïdes 
    2. Terpènes 

  •  

     

     

  • Devoir sur table pour évaluer vos connaissances  et compétences sur l'ensemble du semestre

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Important
Ce syllabus n’a aucune valeur contractuelle. Son contenu est susceptible d’évoluer en cours d’année : soyez attentifs aux dernières modifications.