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UE07 Statistiques appliquees a la biologie

Code de l'ECUE : SMUSVI07

Ce cours est proposé dans 0 UE
EUR LIFE
Mathématiques appliquées et applications des mathématiques
Campus Valrose
Master 1 , Master 2
Semestre impair
Français

PRESENTATION

Cette UE vise à donner aux étudiants une connaissance pratique des techniques statistiques avancées employées dans de nombreux domaines de la biologie. Les grands domaines couverts seront:

  • Rappels de R: manipulation de données et graphiques; tests paramétriques et non paramétriques. Notion de puissance.
  • Modèle linéaire: régression linéaire simple et multiple, colinéarité, ANOVA, ANCOVA, interactions, GLM: régression logistique.
  • Analyse multivariée: composanes principales, analyse des correspondances, analyse discriminante.
  • Analyse de survie.

Si le planning le permet, le bootstrap et les analyses par permutations seront également abordées.

Responsable(s) du cours

Marc Bailly-Bechet

Présentiel

  • 22h de cours magistral
  • 22h de travaux pratiques

PREREQUIS

Avant le début du cours, je dois ...
  • Savoir manipuler des données et produire des graphiques avec le logiciel R
  • Connaître les principaux indicateurs statistiques pour résumer des séries de données: moyenne, médiane, variance, écart-type
  • Connaître les principaux tests statistiques classiques: test de Student, de comparaison de proportion, Chi2

OBJECTIFS

A la fin de ce cours, je devrais être capable de...
  • Interpréter et critiquer des analyses statistiques réalisées avec des tests statistiques classiques
  • Réaliser à l'aide du logiciel R des analyses de type "modèle linéaire", "analyse multivariée" ou "analyse de survie"
  • Interpréter et critiquer des analyses statistiques réalisées dans le cadre du modèle linéaire, d'analyses de survie ou multivariées

CONTENU

  • Rappels sur le logiciel R et sur les tests statistiques.

    Introduction des notions de taille d'effet, taille d'échantillon et puissance.

  • Ici on voit:

    • régression linéaire simple et multiple
    • ANOVA(s)
    • ANCOVA
    • Termes d'interactions dans les analyses précédentes

     

    • Analyse en composantes principales
    • Analyses factorielle des correspondances
    • (si le temps le permet) Analyse linéaire discriminante

  • Théorie, graphiques et analyses classiques de données de survie. Données censurées.

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Important
Ce syllabus n’a aucune valeur contractuelle. Son contenu est susceptible d’évoluer en cours d’année : soyez attentifs aux dernières modifications.