Université Côte d'azur

34-2 Projet bioinformatique

Code de l'ECUE : SMESV342

Ce cours est proposé dans 2 UE
EUR LIFE
Informatique
Campus Valrose
Licence 3
Semestre impair
Français

PRESENTATION

Dans cette ECUE, l'étudiant va réaliser un programme informatique complet permettant d'analyser des données biologiques. Il s'agit d'une mise en application des méthodes vues dans l'ECUE programmation python SLEVI501.

Un projet d'analyse biologique est donné en début d'ECUE, le même pour tout le groupe, avec un cahier des charges fixé. Le projet est découpé en 5-6 étapes de difficulté croissante. Il est demandé dans cette ECUE à des binômes d'étudiants de fournir un programme informatique complet, qui tournera sur toutes architectures et sera robuste. C'est une occasion pour l'étudiant de se confronter aux difficultés inhérentes à la création de programmes utilisables par tous. Contrairement aux exercices de SLEVI501 ou le code informatique est créé pour répondre à des questions précises indépendantes les unes des autres.

Responsable(s) du cours

Christophe Becavin

Présentiel

  • 2h de cours magistral
  • 10h de travaux dirigés

PREREQUIS

Avant le début du cours, je dois ...
  • Maitriser le langage python

OBJECTIFS

A la fin de ce cours, je devrais être capable de...
  • Mettre en oeuvre ses connaissances en python pour analyser des données biologiques
  • Améliorer un programme informatique pour le rendre robuste
  • Publier un programme informatique
  • Assembler des fonctions en python dans un programme

CONTENU

  • Une séance courte où le projet à réaliser est présenté ainsi que les critères d'évaluation. Le choix du binôme se fait à la fin de cette séance.

  • Nous reservons 4 séances de TP pour réaliser votre projet et poser vos questions.

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Important
Ce syllabus n’a aucune valeur contractuelle. Son contenu est susceptible d’évoluer en cours d’année : soyez attentifs aux dernières modifications.