UE10 Modelisation des systemes biologiques

ECUE's code : SMUSVI10

This course give 6.0 ECTS.

Structure

EUR LIFE

Disciplinary domain

Biologie cellulaire

Campus

Campus Valrose

Course's level

Master 2

Semester

Semestre impair

Language

Français

PRESENTATION

Cette UE vise à donner aux étudiants une ouverture vers différentes techniques de modélisation employées actuellement en biologie, et des notions pratiques de base.

Biologie des systèmes ou "systems biology" (C. Bécavin)
Modélisation par équations différentielles (I. Balleli)
Processus stochastiques (S. Girel)
Approche biophysique et modélisation moléculaire (F. Cazals, R. Allena)

Course's manager(s)

, Marc Bailly-Bechet

In class

22h of lectures
22h of practical work

PREREQUISITES

Before the start of the course, I must ...

Avoir des notions en résolution d'équations différentielles aux dérivées partielles.
Connaitre les différentes technologies omiques.

OBJECTIVES

By the end of this course, I should be able to...

Savoir reconstruire et analyser un réseau biologique
Utiliser la modélisation moléculaire en biophysique
Comprendre l'approche systémique en biologie
Connaitre les différentes techniques de modélisation biologique
Comprendre les processus stochastiques
Modéliser un système par équations différentielles

CONTENT

Biologie des systèmes

• L’approche systémique en biologie

• Théorie des réseaux

• Reconstruire un réseau biologique

• Utiliser un réseau biologique

• Modéliser un réseau biologique
Modélisation par équations différentielles

Modèles à compartiments
Biophysique et mécanobiologie

No description
Modélisation moléculaire

Pre-requisites

• Entropy

• Statistical physics – the canonical ensemble

• Chemical reactions

Biomolecular recognition – binding

Molecular modeling

• Biomolecules and their dynamics

• Simulation methods
Processus stochastiques

Présentation de quelques processus temporels stochastiques en biologie

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Important

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