UE10 Modelisation des systemes biologiques

Code de l'ECUE : SMUSVI10

Ce cours donne droit à 6.0 ECTS.

Structure

EUR LIFE

Domaine disciplinaire

Biologie cellulaire

Lieu d'enseignement

Campus Valrose

Niveau du cours

Master 2

Semestre

Semestre impair

Langue

Français

PRESENTATION

Cette UE vise à donner aux étudiants une ouverture vers différentes techniques de modélisation employées actuellement en biologie, et des notions pratiques de base.

Biologie des systèmes ou "systems biology" (C. Bécavin)
Modélisation par équations différentielles (I. Balleli)
Processus stochastiques (S. Girel)
Approche biophysique et modélisation moléculaire (F. Cazals, R. Allena)

Responsable(s) du cours

, Marc Bailly-Bechet

Présentiel

22h de cours magistral
22h de travaux pratiques

PREREQUIS

Avant le début du cours, je dois ...

Avoir des notions en résolution d'équations différentielles aux dérivées partielles.
Connaitre les différentes technologies omiques.

OBJECTIFS

A la fin de ce cours, je devrais être capable de...

Savoir reconstruire et analyser un réseau biologique
Utiliser la modélisation moléculaire en biophysique
Comprendre l'approche systémique en biologie
Connaitre les différentes techniques de modélisation biologique
Comprendre les processus stochastiques
Modéliser un système par équations différentielles

CONTENU

Biologie des systèmes

• L’approche systémique en biologie

• Théorie des réseaux

• Reconstruire un réseau biologique

• Utiliser un réseau biologique

• Modéliser un réseau biologique
Modélisation par équations différentielles

Modèles à compartiments
Biophysique et mécanobiologie

Aucune description
Modélisation moléculaire

Pre-requisites

• Entropy

• Statistical physics – the canonical ensemble

• Chemical reactions

Biomolecular recognition – binding

Molecular modeling

• Biomolecules and their dynamics

• Simulation methods
Processus stochastiques

Présentation de quelques processus temporels stochastiques en biologie

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Important

Ce syllabus n’a aucune valeur contractuelle. Son contenu est susceptible d’évoluer en cours d’année : soyez attentifs aux dernières modifications.