University Côte d'azur
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ECUE Biochimie structurale et régulations enzymatiques

ECUE's code : SLEVM501

Belong to 2 UE
PORTAIL SCIENCES DE LA VIE
Biochimie et biologie moléculaire
Campus Valrose
Licence 3
Semestre impair
Français

PRESENTATION

Ce module est découpé en deux axes :

Biochimie structurale où les étudiants apprendront les principales méthodes de détermination de la structure des protéines (RX, RMN, Cryo-EM), apprendront à manier et utiliser ces structures (outil de visualisation moléculaire avec l'outil Pymol). Ils étudiront également différentes protéines structurellement caractéristiques (moteurs moléculaires, interactions protéine-membrane, protéines membranaires). Des approches de modélisation moléculaire seront abordées (Calcul d'énergie, Drug Design).

Régulation enzymatique: Analyse quantitative d’enzyme à plusieurs substrats et d’enzyme allostériques.

Course's manager(s)

, Eric Macia

In class

  • 20h of lectures
  • 14h of directed studies
  • 6h of practical work

Distant

PREREQUISITES

Before the start of the course, I must ...
  • connaitre les bases de l'enzymologie
  • connaitre les bases de la biochimie

OBJECTIVES

By the end of this course, I should be able to...
  • Connaître les principales méthodes de détermination de la structure des protéines. Apprendre à manier et utiliser ces structures. Etudes de différentes protéines structurellement caractéristiques. Analyse quantitative d’enzyme à plusieurs substrats et d’enzyme allostériques.

CONTENT

  • Les moteurs moléculaires (Kinésine et Dyneine, ATPsynthase), transport = manteaux protéique (clathrin, COP), Dynamine etc, Protéines G, domaines d'interaction avec les lipides membranaires.

  • Structure des protéines:

    Définitions généralités, fichiers PDB, représentation 3D, structure secondaires. Détermination de la structure d'une protéine par diffraction aux rayons X, organisation des cristaux, loi de Bragg. Patterns de diffraction et cartes de densité électronique. Méthodes de cristallisation.

    Calcul d’énergie, visualisation moléculaire.

    Protéines Membranaires

  • Analyse qualitative et quantitative d’enzyme à plusieurs substrats et d’enzyme allostériques.

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