Université Côte d'azur
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ECUE Biochimie structurale et régulations enzymatiques

Code de l'ECUE : SLEVM501

Ce cours est proposé dans 2 UE
PORTAIL SCIENCES DE LA VIE
Biochimie et biologie moléculaire
Campus Valrose
Licence 3
Semestre impair
Français

PRESENTATION

Ce module est découpé en deux axes :

Biochimie structurale où les étudiants apprendront les principales méthodes de détermination de la structure des protéines (RX, RMN, Cryo-EM), apprendront à manier et utiliser ces structures (outil de visualisation moléculaire avec l'outil Pymol). Ils étudiront également différentes protéines structurellement caractéristiques (moteurs moléculaires, interactions protéine-membrane, protéines membranaires). Des approches de modélisation moléculaire seront abordées (Calcul d'énergie, Drug Design).

Régulation enzymatique: Analyse quantitative d’enzyme à plusieurs substrats et d’enzyme allostériques.

Responsable(s) du cours

, Eric Macia

Présentiel

  • 20h de cours magistral
  • 14h de travaux dirigés
  • 6h de travaux pratiques

Distanciel

PREREQUIS

Avant le début du cours, je dois ...
  • connaitre les bases de l'enzymologie
  • connaitre les bases de la biochimie

OBJECTIFS

A la fin de ce cours, je devrais être capable de...
  • Connaître les principales méthodes de détermination de la structure des protéines. Apprendre à manier et utiliser ces structures. Etudes de différentes protéines structurellement caractéristiques. Analyse quantitative d’enzyme à plusieurs substrats et d’enzyme allostériques.

CONTENU

  • Les moteurs moléculaires (Kinésine et Dyneine, ATPsynthase), transport = manteaux protéique (clathrin, COP), Dynamine etc, Protéines G, domaines d'interaction avec les lipides membranaires.

  • Structure des protéines:

    Définitions généralités, fichiers PDB, représentation 3D, structure secondaires. Détermination de la structure d'une protéine par diffraction aux rayons X, organisation des cristaux, loi de Bragg. Patterns de diffraction et cartes de densité électronique. Méthodes de cristallisation.

    Calcul d’énergie, visualisation moléculaire.

    Protéines Membranaires

  • Analyse qualitative et quantitative d’enzyme à plusieurs substrats et d’enzyme allostériques.

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Important
Ce syllabus n’a aucune valeur contractuelle. Son contenu est susceptible d’évoluer en cours d’année : soyez attentifs aux dernières modifications.