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ECUE SV : Biochimie structurale
ECUE's code : SPEB106
PORTAIL SCIENCES DE LA VIE
Biochimie et biologie moléculaire
Campus Valrose
Licence 1
Semestre impair
Français
PRESENTATION
Dans ce cours, vous aborderez le monde du vivant à son niveau moléculaire. Vous utiliserez alors des notions de chimie (atomes, interactions et liaisons, énergie, équilibre, ionisation, pH, dissolution) que vous appliquerez aux systèmes et molécules biologiques en conditions physiologiques afin de comprendre et d'expliquer le lien entre structure et fonction moléculaire d'une molécule. Vous approfondirez le sujet avec trois grandes familles de biomolécules : les protéines, les glucides et les lipides. Vous analyserez leurs structures, apprendrez à prédire leurs propriétés physico-chimiques et biologiques qui déterminent leurs fonctions moléculaires. Enfin, vous découvrirez et appliquerez les méthodes d’études qui leur sont spécifiques et adaptées.
Ce module nécessite un travail personnel important et continu hors des séances d'enseignements.
Course's manager(s)
, Sophie Raisin
In class
- 18h of lectures
- 12h of directed studies
PREREQUISITES
Before the start of the course, I must ...
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- faire la différence entre formule brute, représentation semi-développée et représentation développée - connaitre les bases de la structure électronique des atomes C,H,O,N et P et savoir l'utiliser pour déterminer la valence des atomes, l'impact des doublets non liants sur la structure et déterminer les liaisons entre atomes pour représenter les molécules - connaitre la notion d'électronégativité, appliquer et expliquer son impact sur la polarité des liaisons - connaitre la définition et la nature électronique des liaisons covalentes et l'impact de l'électronégativité sur leurs caractéristiques - connaitre l'origine physique des liaisons faibles ou interactions et comprendre l'impact de la charge et de la distance entre atomes sur l'intensité (ou force) des liaisons faibles - connaitre la définition du pH, du pKa et les formules associées - connaitre la définition d'une base, d'un acide selon Bronsted et les réactions acido-basiques associées
OBJECTIVES
By the end of this course, I should be able to...
- Reconnaitre, nommer, dessiner une molécule protéique, glucidique ou lipidique en utilisant les règles et nomenclatures scientifiques
- Déduire des propriétés moléculaires ou des caractéristiques en s'appuyant sur la structure d'une molécule protéique, glucidique ou lipidique
- Proposer ou expliquer une fonction biologique à partir des propriétés moléculaires ou des caractéristiques d'une molécule protéique, glucidique ou lipidique
- Enoncer le principe, décrire le fonctionnement et expliquer ou prédire les résultats obtenus dans le cadre d'expériences d'étude des acides aminés, peptides et protéines
CONTENT
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CM Introduction
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CM Des acides aminés aux protéines (8h)
No description
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TD1 : pH, tampon, équilibre acide base
No description
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TD2 : Ionisation des acides aminés (AA)
No description
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TD3 : Analyse AA, peptides + Exo Flash 1 (10 minutes – TD1-2)
No description
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TD4 : Techniques d'étude des peptides/protéines
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CM Les glucides (2h)
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TD5 : Glucides + Exo Flash 2 (10 minutes – TD3-4)
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CM Les lipides (2h)
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TD6 : Lipides
No description
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