ECUE SV : Biochimie structurale

Code de l'ECUE : SPEB106

Ce cours est proposé dans 2 UE

Structure

PORTAIL SCIENCES DE LA VIE

Domaine disciplinaire

Biochimie et biologie moléculaire

Lieu d'enseignement

Campus Valrose

Niveau du cours

Licence 1

Semestre

Semestre impair

Langue

Français

PRESENTATION

Dans ce cours, vous aborderez le monde du vivant à son niveau moléculaire. Vous utiliserez alors des notions de chimie (atomes, interactions et liaisons, énergie, équilibre, ionisation, pH, dissolution) que vous appliquerez aux systèmes et molécules biologiques en conditions physiologiques afin de comprendre et d'expliquer le lien entre structure et fonction moléculaire d'une molécule. Vous approfondirez le sujet avec trois grandes familles de biomolécules : les protéines, les glucides et les lipides. Vous analyserez leurs structures, apprendrez à prédire leurs propriétés physico-chimiques et biologiques qui déterminent leurs fonctions moléculaires. Enfin, vous découvrirez et appliquerez les méthodes d’études qui leur sont spécifiques et adaptées.

Ce module nécessite un travail personnel important et continu hors des séances d'enseignements.

Responsable(s) du cours

, Sophie Raisin

Présentiel

18h de cours magistral
12h de travaux dirigés

PREREQUIS

Avant le début du cours, je dois ...

- faire la différence entre formule brute, représentation semi-développée et représentation développée - connaitre les bases de la structure électronique des atomes C,H,O,N et P et savoir l'utiliser pour déterminer la valence des atomes, l'impact des doublets non liants sur la structure et déterminer les liaisons entre atomes pour représenter les molécules - connaitre la notion d'électronégativité, appliquer et expliquer son impact sur la polarité des liaisons - connaitre la définition et la nature électronique des liaisons covalentes et l'impact de l'électronégativité sur leurs caractéristiques - connaitre l'origine physique des liaisons faibles ou interactions et comprendre l'impact de la charge et de la distance entre atomes sur l'intensité (ou force) des liaisons faibles - connaitre la définition du pH, du pKa et les formules associées - connaitre la définition d'une base, d'un acide selon Bronsted et les réactions acido-basiques associées

OBJECTIFS

A la fin de ce cours, je devrais être capable de...

Reconnaitre, nommer, dessiner une molécule protéique, glucidique ou lipidique en utilisant les règles et nomenclatures scientifiques
Déduire des propriétés moléculaires ou des caractéristiques en s'appuyant sur la structure d'une molécule protéique, glucidique ou lipidique
Proposer ou expliquer une fonction biologique à partir des propriétés moléculaires ou des caractéristiques d'une molécule protéique, glucidique ou lipidique
Enoncer le principe, décrire le fonctionnement et expliquer ou prédire les résultats obtenus dans le cadre d'expériences d'étude des acides aminés, peptides et protéines

CONTENU

CM Introduction

Aucune description
CM Des acides aminés aux protéines (8h)

Aucune description
TD1 : pH, tampon, équilibre acide base

Aucune description
TD2 : Ionisation des acides aminés (AA)

Aucune description
TD3 : Analyse AA, peptides + Exo Flash 1 (10 minutes – TD1-2)

Aucune description
TD4 : Techniques d'étude des peptides/protéines

Aucune description
CM Les glucides (2h)

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TD5 : Glucides + Exo Flash 2 (10 minutes – TD3-4)

Aucune description
CM Les lipides (2h)

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TD6 : Lipides

Aucune description

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Important

Ce syllabus n’a aucune valeur contractuelle. Son contenu est susceptible d’évoluer en cours d’année : soyez attentifs aux dernières modifications.