University Côte d'azur

UE34 Introduction a la bio-informatique par la programmation

ECUE's code : SMUSVI34

This course give 6.0 ECTS.
EUR LIFE
Informatique , Mathématiques , Biologie cellulaire
Campus Valrose
Master 1 , Master 2
Semestre impair
Français

PRESENTATION

La bio-informatique est un champ de recherche multi-disciplinaire (biologie, informatique, mathématiques, physique...) dont le but est de répondre aux besoins nouveaux d'analyse et d'interprétation des informations générées par les biotechnologies.

La bio-informatique est constituée par l'ensemble des concepts et des techniques nécessaires à l'interprétation informatique de l'information biologique. La programmation informatique est un bon moyen pour aborder cette discipline.

L’objectif de cet enseignement est d’apprendre à manipuler des données simples grâce à un ordinateur.

Aucun prérequis n'est demandé, ce cours s'adresse à tout étudiant qui désire comprendre comment manipuler informatiquement des données biologiques.

L'étudiant aura acquis au cours de cet enseignement les bonnes méthodes et aura les compétences pour manipuler des données plus riches.


Ce cours se focalise sur l'apprentissage de la programmation en Python, ce qui permettra aux étudiants d'aborder par la suite bio-Python sans grande difficulté.

Les différents points abordés seront:
- introduction à la programmation
- structures de données simples
- expressions conditionnelles
- définition de fonctions et procédures
- les listes et les dictionnaires


La moitié de l'enseignement se fera autour de Travaux Dirigés qui permettront aux étudiants de se confronter à l'ordinateur. Les exemples pris relèveront de l'analyse des séquences biologiques.

Course's manager(s)

Jean-Paul Comet

In class

  • 22h of lectures
  • 22h of directed studies

PREREQUISITES

No prerequisite

OBJECTIVES

By the end of this course, I should be able to...
  • manipuler informatiquement des données biologiques grâce à un ordinateur
  • programmer en Python de manière à pouvoir, par la suite, aborder le bio-Python

CONTENT

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