Université Côte d'azur

UE34 Introduction a la bio-informatique par la programmation

Code de l'ECUE : SMUSVI34

Ce cours donne droit à 6.0 ECTS.
EUR LIFE
Informatique , Mathématiques , Biologie cellulaire
Campus Valrose
Master 1 , Master 2
Semestre impair
Français

PRESENTATION

La bio-informatique est un champ de recherche multi-disciplinaire (biologie, informatique, mathématiques, physique...) dont le but est de répondre aux besoins nouveaux d'analyse et d'interprétation des informations générées par les biotechnologies.

La bio-informatique est constituée par l'ensemble des concepts et des techniques nécessaires à l'interprétation informatique de l'information biologique. La programmation informatique est un bon moyen pour aborder cette discipline.

L’objectif de cet enseignement est d’apprendre à manipuler des données simples grâce à un ordinateur.

Aucun prérequis n'est demandé, ce cours s'adresse à tout étudiant qui désire comprendre comment manipuler informatiquement des données biologiques.

L'étudiant aura acquis au cours de cet enseignement les bonnes méthodes et aura les compétences pour manipuler des données plus riches.


Ce cours se focalise sur l'apprentissage de la programmation en Python, ce qui permettra aux étudiants d'aborder par la suite bio-Python sans grande difficulté.

Les différents points abordés seront:
- introduction à la programmation
- structures de données simples
- expressions conditionnelles
- définition de fonctions et procédures
- les listes et les dictionnaires


La moitié de l'enseignement se fera autour de Travaux Dirigés qui permettront aux étudiants de se confronter à l'ordinateur. Les exemples pris relèveront de l'analyse des séquences biologiques.

Responsable(s) du cours

Jean-Paul Comet

Présentiel

  • 22h de cours magistral
  • 22h de travaux dirigés

PREREQUIS

Pas de prérequis

OBJECTIFS

A la fin de ce cours, je devrais être capable de...
  • manipuler informatiquement des données biologiques grâce à un ordinateur
  • programmer en Python de manière à pouvoir, par la suite, aborder le bio-Python

CONTENU

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Important
Ce syllabus n’a aucune valeur contractuelle. Son contenu est susceptible d’évoluer en cours d’année : soyez attentifs aux dernières modifications.