Université Côte d'azur

ECUE Atelier omique

Code de l'ECUE : SMESVI02

Ce cours appartient à UE01 Données biologiques en pratique 1 (6 ECTS) qui contient 2 ECUE
EUR LIFE
Biochimie et biologie moléculaire , Biologie cellulaire
Campus Valrose
Master 1 , Master 2
Semestre impair
Français

PRESENTATION

Cette ECUE est à l'intersection entre les cours de omiques, programmation de statistiques. Elle a pour objectifs:

  1. D'apprendre aux étudiants l'usage d'outils et de pipeline bioinformatiques classiques.
  2. De permettre l'échange avec les ingénieurs des plate-forme de bioinformatique et analyse des données de la région niçoise.
  3. De compléter et renforcer par des approches pratiques les connaissances obtenues dans l'UE de "Technologies omiques"

 

Responsable(s) du cours

Marc Bailly-Bechet

Présentiel

  • 6h de cours magistral
  • 16h de travaux pratiques

PREREQUIS

Avant le début du cours, je dois ...
  • Maitriser les technologies omiques

OBJECTIFS

A la fin de ce cours, je devrais être capable de...
  • Employer l'outil GALAXY pour réaliser des analyses omiques reproductibles
  • Analyser des données omiques
  • Avoir une expérience pratique des techniques d'analyse les plus courantes: assemblage de génome, analyse de transcriptome, recherche de SNP, analyse épigénétiques... à l'aide de pipelines et de logiciels à paramétrer

CONTENU

  • Outil : Galaxy

  • Aucune description
  • Aucune description
  • Aucune description
  • Usage du logiciel et de la banque de données d'imagerie OMERO

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Important
Ce syllabus n’a aucune valeur contractuelle. Son contenu est susceptible d’évoluer en cours d’année : soyez attentifs aux dernières modifications.