Université Côte d'azur

UE28 Biochimie structurale

Code de l'ECUE : SMUSVI28

Ce cours donne droit à 6.0 ECTS.
EUR LIFE
Biochimie et biologie moléculaire
Campus Valrose
Master 1 , Master 2
Semestre impair
Anglais

PRESENTATION

Grâce à ce module, vous découvrirez en détails les grandes notions de biochimie structurale.

Nous aborderons les techniques

  • expérimentales,
  • de biophysique,
  • de bio-informatique structurale
  • de modélisation moléculaire (modélisation par homologie, drug design, dynamique moléculaire),

De plus, nous étudierons des exemples d’assemblages macro-moléculaire et de leurs dynamiques.

Responsable(s) du cours

Romain Gautier

Présentiel

  • 22h de cours magistral
  • 10h de travaux dirigés
  • 10h de travaux pratiques

PREREQUIS

Avant le début du cours, je dois ...
  • utiliser l'outil de visualisation moléculaire (Pymol)
  • analyser de séquences biologiques,
  • maitriser la biochimie des protéines et des membranes,

OBJECTIFS

A la fin de ce cours, je devrais être capable de...
  • Réaliser un projet de modélisation moléculaire, à partir d'une étude structurale sur une séquence protéique avec proposition d’un modèle structurale via des outils bio-informatiques de type Modélisation par homologie

CONTENU

  • 1- Introduction Biochimie structurale, 24h

    Outils d’analyses et prédiction / structure
    TP sur machine (Outils bio-informatiques, Pymol)
    Base de la modélisation moléculaire
    Etude d’un cas de modélisation par homologie

    R. Gautier (MC, IPMC)

  • 2- Techniques de biophysiques, 10h

    G. Drin (DR CNRS, IPMC)

  • 3- Assemblage macro-molécule, 4h

    L. Counillon (PR, LP2M)

  • Examen terminal avec documents (2 sujets) de 3h ainsi qu’un projet de modélisation moléculaire (étude structurale sur une séquence protéique avec proposition d’un modèle structurale vie des outils bio-informatiques de type Modélisation par homologie).

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Important
Ce syllabus n’a aucune valeur contractuelle. Son contenu est susceptible d’évoluer en cours d’année : soyez attentifs aux dernières modifications.