Université Côte d'azur

UE28 Biochimie structurale

Code de l'ECUE : SMUSVI28

Ce cours donne droit à 6.0 ECTS.
EUR LIFE
Biochimie et biologie moléculaire
Campus Valrose
Master 1 , Master 2
Semestre impair
Anglais

PRESENTATION

Grâce à ce module, vous découvrirez en détails les grandes notions de biochimie structurale.

Nous aborderons les techniques

  • expérimentales,
  • de biophysique,
  • de bio-informatique structurale
  • de modélisation moléculaire (modélisation par homologie, drug design, dynamique moléculaire),

De plus, nous étudierons des exemples d’assemblages macro-moléculaire et de leurs dynamiques.

Responsable(s) du cours

Romain Gautier

Présentiel

  • 22h de cours magistral
  • 10h de travaux dirigés
  • 10h de travaux pratiques

PREREQUIS

Avant le début du cours, je dois ...
  • utiliser l'outil de visualisation moléculaire (Pymol)
  • analyser de séquences biologiques,
  • maitriser la biochimie des protéines et des membranes,

OBJECTIFS

A la fin de ce cours, je devrais être capable de...
  • Comprendre les différentes méthodes expérimentales autour de la biochimie et biophysique des membranes et protéines membranaires. Analyser des séquences et visualiser des macromolécules biologiques afin de mieux comprendre les relations structures-fonctions. Réaliser un projet de modélisation moléculaire, à partir d'une étude structurale sur une séquence protéique avec proposition d’un modèle structurale via des outils bio-informatiques de type Modélisation par homologie

CONTENU

  • 1- Introduction Biochimie structurale, 24h

    Outils d’analyses et prédiction / structure
    TP sur machine (Outils bio-informatiques, Pymol)
    Base de la modélisation moléculaire
    Etude d’un cas de modélisation par homologie

    R. Gautier (MC, IPMC)

  • 2- Techniques de biophysiques, 10h

    G. Drin (DR CNRS, IPMC)

  • 3- Assemblage macro-molécule, 4h

    L. Counillon (PR, LP2M)

  • Examen terminal avec documents (2 sujets) de 3h ainsi qu’un projet de modélisation moléculaire (étude structurale sur une séquence protéique avec proposition d’un modèle structurale vie des outils bio-informatiques de type Modélisation par homologie).

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Important
Ce syllabus n’a aucune valeur contractuelle. Son contenu est susceptible d’évoluer en cours d’année : soyez attentifs aux dernières modifications.